根據《僱傭條例》規定，若僱員缺勤，僱主可扣除實際缺勤時間的工資。

但需要閣下進一步提供資料方能準確解答, 如為什麼該員工維持此狀況多年但公司到現時才來進行扣薪行動，公司與該
員工之間是否存在著相關問題的口頭或書面協議？這方面請閣下再作詳盡的析述，謝謝。

如需進一步協助，請致電2779 3766黃先生/邱先生/儲先生聯絡。

以上觀點謹供參考，意見會因當事人提供的資料是否清晰而有所影響。