公司有一部份佣金是三個月後才會結算的，即現在4月才結算到1月份的佣金，當我辭職時，我發現最後的糧單並沒有結算我1-4月的佣金，公司說根據某一條僱傭條例可以不發放給辭職同事，請問這樣合法/合理嗎？真的有這一條法例嗎？

都係睇合約點樣寫，如果寫明該佣金按業績發放，並無其他附加條件，不能隨便扣走。
如果霸王條款，或寫作酌情性獎金的話，公司確實有權不發放。
建議你斟酌下份合約